Głównym przeciwwskazaniem jest trudny do opanowania lęk przed dietą, który wyzwala w organizmie reakcje stresowe uniemożliwiające włączenie się własnych samoleczących mechanizmów.
- stosowanie leków hamujących układ immunologiczny takich, jak na przykład hormony sterydowe czy cytostatyki,
również posterydowa lub autoagresyjna niedoczynność nadnerczy (choroba Adisona)
- krańcowa niewydolność narządów
- gruźlica
- kacheksja
- choroba nowotworowa w stadium zaawansowanym
- stany związane ze wzmożonym metabolizmem jak nadczynność tarczycy
- okres ciąży i karmienia
- w przypadku transplantacji narządów np. nerek
- ciężkie depresje